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期待基因测序技术更多走入临床|成都贝斯达仪器有限公司

2011年7月8日,由中华医学会北京分会检验医学分会主办,首都医科大学附属北京同仁医院承办,Life Technologies公司协办的“2011年基因测序技术临床应用学术研讨会”在北京同仁医院会议室召开,约100余人参加了此次会议。中华医学会北京分会会长金大鹏先生、首都医科大学附属北京同仁医院院长韩德民先生、中华医学会北京分会检验医学分会主任委员郭建先生,以及Life Technologies公司大中华区市场总监Jason LIU先生等参加会议并致辞。

 

 

 

  此次研讨会以基因测序技术临床应用为主题,就基因测序技术的发展历史及该技术在临床中的实际应用情况等进行了探讨,Life Technologies公司大中国区测序产品经理王博飞先生、江苏省中医院病理科主任医师赖仁胜教授、首都医科大学附属北京同仁医院检验科主任医师鲁辛辛女士分别作了“测序技术,从基础研究到临床诊断”、“综合多技术医学基因平台的实践——临床医学基因规范检测应用”及“微生物基因测序技术的临床应用”的报告。

 

  据王博飞先生介绍,上世纪90年代初,人类基因组计划正式启动,在经过10年时间,2001年初,一个人的基因组草图发表,当时科学家们所用的测序平台就是第一代测序仪,俗称毛细管基因分析仪;2006年,以454公司(现并入Roche公司)模型机为代表的第二代测序仪出现,与第一代测序仪相比,第二代测序仪以“边合成边测序”为核心思想,从而实现了高通量测序;未来,引领新的应用潮流的第三代测序仪也在陆续研发中,如单分子测序仪等。2010年,Life Technologies公司推出了全新的半导体测序技术Ion Torrent PGMTM,该技术摈弃了前两代测序仪所采用的光学检测技术,而是采用半导体芯片技术,通过密布于芯片上的微反应器孔和感应器来检测基因序列,相比于第二代测序仪,其完成一次测试的时间是2小时,检测通量相对较高。

 

 

  鲁辛辛女士在报告中介绍说,“第二代测序仪主要有Life Technologies公司SOLID System、Roche公司 454 FLX、Illumina公司 Solexa Genome Analyzer;第三代测序仪则以Helicos公司的单分子测序仪及Complete Genomics公司DNA纳米阵列与组合探针锚定链接测序法为代表。

  关于测序仪在临床的应用情况,王博飞先生表示,由于第一代测序仪成熟、稳定,目前应用于临床检测的测序仪基本上全是第一代测序仪,而Life Technologies公司是第一代测序仪的技术引领者,现有仪器3500/3730。而蕞新推出的基因测序仪Ion Torrent PGMTM由于可以在2小时内完成一次测试,具有更广阔的应用前景。在今年5月德国乃至欧洲爆发的大肠杆菌O104疫情风暴中,Ion Torrent PGMTM被全世界不同实验室选为确定大肠杆菌O104来源平台,在三天时间内完成实验过程,确定了大肠杆菌O104的来源。

 

 

  赖仁胜教授在报告中说,上月在美国召开的临床肿瘤学会会议上,会议主席提及“现在的肿瘤研究与治疗已经进入‘基因潮’时代”,可见基因测序在肿瘤临床方面的热度。同时赖仁胜教授表示,江苏省中医院病理科是国内较早开展基因测序业务的医院,目前病理科拥有3台测序仪,是Kars基因中国区中心实验室。多年来,医院结合基因测序技术在癌症的个性化治疗方面取得了很好的治疗效果。

  鲁辛辛女士则介绍了基因测序在临床微生物确定、微量核酸分析、流行株确认及耐药性确认方面的实际应用。

 


  在研讨会蕞后的媒体提问环节,笔者问及Ion Torrent PGMTM的推出是否会对Life Technologies前两代测序仪的销售带来冲击时,Jason LIU先生表示,“俗话说‘长江后浪推前浪’,新的产品对老的产品永远都有竞争性,在一段时间内,新产品会取代老产品。但是我们也同时相信,老的产品有非常顽强的生命力。特别是如第一代毛细管测序仪,目前Life Technologies该类产品在全球的销售数量远超过10000台,第一代测序仪在科研领域是‘金标法’。第一代测序仪虽然在速度及通量方面不如新产品,但是我们发现第一代测序仪的越来越多地应用于临床。而临床应用与基础科研不同,临床要求准确性与稳定性,而第一代测序仪经过了时间的检验具有这方面的优势。也就是说,第一代测序仪并未消亡与取代,反而在新的领域找到新的生命力。”

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